Cikal bakal Madrasah Tsanawiyah Negeri Jetis Ponorogo bermula pada saat tahun 1964, pada saat itu lokasi madrasah masih berada di komplek Masjid Jami’ Tegalsari Jetis Ponnorogo di bawah naungan “Yayasan Pendidikan Ronggo Warsito”, dengan nama Pendidikan Guru Agama Ronggo Warsito (PGA RONGGO WARSITO).

Seiring berjalanya waktu dan perkembangan peraturan yang yang berlaku di Negara ini,  Pada tahun 1968 berdasarkan Surat Keputusan Departemen Agama pada saat itu “PGA Ronggo Warsito” mengalami proses penegerian sehingga mengalami perubahan nama menjadi “Pendidikan Guru Agama Negeri 6 Tahun” dan sekaligus lokasi madrasah direlokasi/pindah ke komplek Masjid Jami’ desa Karanggebang kecamatan Jetis Kabupaten Ponorogo.

Tidak berhenti disitu saja, karena terjadinya perubahan dan perkembangan konsep pendidikan Agama di negara ini berdasarkan Surat Keputusan Departemen Agama pada tahun 1970 “Pendidikan Guru Agama Negeri 6 Tahun” berubah nama lagi menjadi “Pendidikan Guru Agama Negeri 4 tahun”.  Kemudian Pada tahun 1979 madrasah direlokasi yang kedua kalinya ke Desa Josari Jetis Ponorogo dan berubah nama menjadi MTs NEGERI JETIS PONOROGO. Kemuadian pada tahun 2016, sesuai dengan Keputusan Menteri Agama(KMA) Nomor: 673 Tahun 2016 Tentang perubahan nama Madrasah Aliyah Negeri, Madrasah Tsanawiyah Negeri dan Madrasah Ibtidaiyah Di Negeri Provinsi Jawa Timur Tanggal 17 November 2016 berubah nama lagi menjadi MTs NEGERI 1 PONOROGO sampai dengan sekarang.

Berikud daftar nama-nama Kepala MTsN Jetis Ponorog  sejak 1979 – Sekarang

1 Drs. Zainun Shofwan 1979 – 1986

2 Kusto, BA. 1986 – 1993

3 Chozin, SH. 1993 – 1999

4 Drs. Imam Asj’ari, SH. 1999 – 2002

5 Drs. Muhammad Cholid, MA. 2002 – 2006

6 H. Imam Sjafi”i, S.Pd., M.Si. 2006 – 2009

7 H. Wiyono, S.Pd.I., M.Si. 2009 – 2016

8 Nuurun Nahdiyyah, KY. M.Pd.I 2016 –2023

9 H. Agus Darmanto, S.Pd, M.Pd 2023 – sekarang